Oggi proprietà dell'IRE, l'ente pubblico che gestisce servizi per anziani e minori, l'oratorio fa parte dei monumenti della carità veneziana, luoghi un tempo retlti da confraternite di nobili e borghesi.
E' 'ennesima iniziativa che vede l'Associazione Sant'Apollonia e l'IRE impegnate nel servizio ai visitatori, che desiderano conoscere la storia, gli aspetti iconografici e artistici ed inoltre la funzione originaria di questi luoghi, che rimane ininterrottamente testimoniata anche dall'uso attuale dei diversi siti.
L'Ospizio,di cui l'Oratorio parte, fu probabilmente fondato verso la metàdel XII secolo, da un piccolo gruppo di frati dell'Ordine dei Crociferi proveniente da Roma, che svolse a Venezia una funzione sociale altamente utile nel campo dell'assistenza ai malati e dell'ospitalità dei pellegrini.
In epoca cinquecentesca una serie di ristrutturazioni culminò nella decorazione dell'oratorio affidata a Jacopo Palma il Giovane che la realizzò tra il 1583 ed il 1592. Negli otto teleri che occupano tutte le pareti sono raffigurate con forte realismo le vicende legate alla storia dell'ospedale e dell'Ordine ed alcuni momenti della tradizione cristiana, momenti liturgici a cui costoro erano particolarmente devoti.

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